A detecção quantitativa de ácidos nucleicos é um método poderoso para os mais diversos tipos de aplicações. Este método é uma modificação da Reação da Polimerase em Cadeia - PCR convencional, na qual fragmentos de DNA são amplificados e seus produtos são detectados em tempo real por meio da leitura de fluorescência emitida, proporcional à quantidade de moléculas. A base deste método é a adição de fluoróforos (intercalante de DNA SYBRGreen I, sondas Taqman ou outros) no mix da reação e acoplamento de um leitor de fluorescência com filtros específicos para diferentes fluoróforos. Dependendo do desenho do ensaio e do equipamento disponível, mais de um fragmento específico pode ser quantificado por vez. Os resultados podem ser obtidos em cerca de 40 minutos.